一部记录名侦探柯南和海东小子之间对抗的电影，包括用新的动画重拍海东小子首次亮相。

　　故事发生在遥远的未来，金城拓人（保志总一朗 配音）本是一位平凡的大学生，某日，他和女友玛琪（桑岛法子 配音）参与了一场实验，然而，实验中发生了事故，导致邪恶的外星人弗兰克复活，试验所惨遭破坏，玛琪丧命，拓人亦因此而遭到了毁容。　　在神秘人的帮助之下，拓人捡回了一条命，并且以龙·索玛的身份重新回到

　　獅子王凱是改造人，改造他的父亲獅子王麗雄在他体内放入了神奇的宝石Gストーン。獅子王凱地球的和平，和邪恶的ゾンダー展开了战斗。

东京东渡线地铁开通当天，发生了针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击，导致东渡线列车受损。经过一番推理，柯南等人认定这与八年前由朝仓主持的北知泽大坝建设有关。为了修建大坝，朝仓动员北知泽村的人搬入新村，但很多人直到最后阶段仍在抵抗。为了查明，柯南、芦原(めぐみ林园配音)、少年侦探团和理查德·摩尔(小山理

东京、大阪和京都都发生了谋杀案，五名死者都是被蒙面黑人用山城和弓箭瞬间杀死的。警方介入调查后发现，死者都是专门在三个地方盗窃著名佛像和艺术品的盗窃集团“源氏萤火虫”的成员。团里有8个成员，以易经大臣的名字互相称呼，都拿着一把《义经记》，5个受害者手中的《义经记》被抢走。这一天，京都的古寺善能寺收到了

柯南在街上目睹了一名正在打的警察在雨中被枪杀。他试图追踪凶手，但凶手逃脱了。受害者闭上眼睛，抓了一下自己的左胸，似乎暗示了什么。事后，柯南从警官蒋木木口中得知，抓住左胸是暗示那里有一本警察手册。很快又有一名警察在地下车库中枪，手里拿着一本警用手册。对于这两起案件，警官牧牧等人一反常态地不愿意向毛利小

柯南、足原诚司和少年侦探队的成员步美博士、广彦博士、元太岁博士这一天露营完毕，绕道去参观富士山前新建成的西多摩日本第一双子塔。毛利小五郎还被双子塔的主人和他的师妹张攀邀请参加开幕式。在若松美雪 经人介绍，他们认识了以画富士山而闻名的画家，如岳风水、市议员、双子塔的设计者、秀彦(森谷帝二，森谷曾在第一

小兰 的朋友，原子铃木财团，将展出—— ;沙皇·尼古拉斯二世的家庭。记忆之蛋里有沙皇·尼古拉斯二世一家的珍贵照片，特别珍贵。没想到，在展览之前，我收到了海东黑场的通知函，上面隐晦地列出了他盗宝的时间。原子找小兰 的父亲，侦探毛利小五郎，寻求帮助。当然，真正的幕后大师柯南也会和小兰一起来。柯南遇到了

一辉·友本是一位著名的钢琴家。两年前，他突然宣布不再弹钢琴，改攻管风琴。他甚至花钱建造了友本音乐厅，并准备在竣工当天举办一场音乐会。然而，在音乐会开始前，唐本音乐学院的学生相继死去，先是被炸弹炸死，然后是被个人杀害。园方带着柯南一行来到彩排现场，遇到了女高音秋庭怜子，有着绝对音感的丘挺开始遭遇危险: