在第二季中，《毒枭：墨西哥》继续讲述米盖尔·安吉尔·菲利斯·加拉多的故事。他现在是墨西哥最大的贩毒集团(瓜达拉哈拉贩毒集团)的教父。他一直试图保持对所有势力的控制，发展自己的帝国，不断调和自己在成为教父的路上所面临的背叛和牺牲。随着不同 "广场 "贩毒集团愈演愈烈。;美国对局势的控制也减弱了。与此同