在与戈鲁戈姆战斗后半年，本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下，但光太郎不答应，于是杰克将军便将其变身机能破坏。　　变身机能破坏的情况下，光太郎被扔往宇宙。在即将变为宇宙尘埃的时候，光太郎被神秘的太阳光线照射，其体内的帝王石亦产生了变化，光太郎也

在一个小村庄的中学里，对考古学感兴趣的老师八石高(竹中直人)和他的学生月岛紫菱(めぐみ上野)在一次研究中失踪了。当时学校里人心惶惶，各种传言和猜测无处不在。一位行为怪异的考古学家森田里次郎(田田健二饰)应巴布老师的邀请来到这所学校，他意外救出了巴布的儿子工藤正雄。郑雄担心他的父亲 安全，但也想念他暗