在与戈鲁戈姆战斗后半年，本应取回的和平突然被怪魔界克萊西斯帝国打破。克萊西斯帝国的杰克将军想拉拢南光太郎作为部下，但光太郎不答应，于是杰克将军便将其变身机能破坏。　　变身机能破坏的情况下，光太郎被扔往宇宙。在即将变为宇宙尘埃的时候，光太郎被神秘的太阳光线照射，其体内的帝王石亦产生了变化，光太郎也

由于怪物的突然袭击，地球上的人类几乎灭绝了。为了人类最后的希望，由七位女性组成的U队，守护着地球上最后一个孩子。与此同时，因为听到召唤而从其他宇宙赶来的西罗·奥特曼、达纳·奥特曼、高斯·奥特曼成功加入了u队，而入侵地球的幕后元凶巴克斯特也将他的魔手伸向了地球上仅存的孩子...